Cas-Φ : un outil de plus pour l’édition du génome

Publié le 28 Juil, 2020

Une nouvelle enzyme « exceptionnellement petite », d’« environ la moitié de la taille de Cas9 », a été découverte par des chercheurs américains de l’université de Californie. Appelée Cas-Φ (Cas-phi), cette nouvelle protéine est « un ajout hyper compact à la boîte à outils d’édition du génome » selon les chercheurs. Elle a été testée « sur des cellules humaines et végétales in vitro ». Les résultats ont été publiés dans la revue Science[1].

« Actuellement, l’utilisation de la technologie CRISPR/Cas pour l’édition du génome est limitée par la difficulté de fournir de grandes protéines Cas aux cellules ». Pour le professeur Jennifer Doudna, « pionnière de CRISPR et co-auteur principal du groupe de recherche à l’université de Californie », « ce tout petit système CRISPR/Cas, codé par un virus, pourrait être un moyen de franchir cette barrière ». Et « en raison de sa petite taille, Cas-Φ peut accéder et couper plus de régions des génomes humains et végétaux que les autres protéines Cas communes ».

Par ailleurs, à l’inverse « d’autres protéines Cas plus courantes, telles que Cas9, [qui] dépendent de protéines complémentaires pour fonctionner », l’enzyme Cas-Φ peut « remplir toutes les fonctions par elle-même ». Une autre spécificité de Cas-Φ est son aptitude à couper l’ADN double brin, comme celui que l’on trouve dans les cellules humaines.

Les recherches menées par l’Université de Californie, sous la direction du professeur Jill Banfield, avaient permis d’identifier Cas-Φ au début de l’année. « Preuve de l’existence des protéines Cas dans les virus plutôt que dans les bactéries ou autres organismes unicellulaires ». « Les virus sont connus sous le nom de bactériophages, et ces origines peuvent expliquer les propriétés inhabituelles de Cas-Φ. » Les résultats avaient été publiés en février dans la revue Nature[2].

Pour aller plus loin :

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[1] CRISPR-CasΦ from huge phages is a hypercompact genome editor

[2] Clades of huge phages from across Earth’s ecosystems

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